水样的采集和保存应注意事项：测定悬浮物、pH、溶解氧、生化需氧量、油类、硫化物、余氯、放射性、微生物等项目需要单独采样；其中测定溶解氧、生化需氧量和有机污染物等项目的水样必须充满容器；pH、电导率、溶解氧等项目宜在现场测定。
水样采集与保存，是指农田生态系统中的水样一般有雨水、灌溉水、径流水和土壤渗漏水等，应根据研究的要求按规定进行采样与保存。雨水的采集可从气象站量雨筒中取样，或用容器放置于露天，待降雨时接收水样；灌溉水的采集宜在灌水沟渠中进行，或在水库、山塘、河流、水井等水源处取样，注意不要在施过肥的稻田中取样；径流水可取自测量径流量设施的出水口；土壤渗漏水可以通过埋设地下排水管或建立排水采集器来采集。
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