蛋白质的二级结构是指多肽链主链骨架盘绕折叠而形成的构象，借氢键维系。主要有以下几种类型：
⑴α-螺旋：其结构特征为：
①主链骨架围绕中心轴盘绕形成右手螺旋；
②螺旋每上升一圈是3.6个氨基酸残基，螺距为0.54nm；
③相邻螺旋圈之间形成许多氢键；
④侧链基团位于螺旋的外侧。
⑵β-折叠：其结构特征为：
①若干条肽链或肽段平行或反平行排列成片；
②所有肽键的C=O和N—H形成链间氢键；
③侧链基团分别交替位于片层的上、下方。
⑶β-转角：多肽链180°回折部分，通常由四个氨基酸残基构成，借1、4残基之间形成氢键维系。
⑷无规卷曲：主链骨架无规律盘绕的部分。
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